La porte de San Juan doit son nom au fait de constituer la sortie de l’ermitage de San Juan de Gaztelugatxe. C’était la porte principale de la muraille, couronnée par une construction en forme de tour.
La porte date du XIVº siècle et s’ouvre par un arc surbaissé à l’intérieur de la ville, alors que vers l’extérieur elle présente un arc ogival. Entre les deux se trouve la rainure à travers laquelle on abaissait la porte qui fermait la ville. Au-dessus de l’arc surbaissé se situe une niche avec l’image de San Juan.
Aux XIIIº et XIVº siècle, Bermeo était le chef-lieu de Biscaye et la ville biscayenne avec le plus d’activité économique, s’agissant d’un des ports les plus commerciaux de toute la péninsule. On exportait de grandes quantités de poisson vers l’intérieur et on en revenait chargé de vin, de bois et de charbon pour leur transport ultérieur par voie maritime.